基礎處理：
（1）水下清淤與平整：如果河床不平整或有淤泥等軟弱層，需要進行水下清淤工作。可以使用抓斗式挖泥船或水力沖淤設備清除淤泥，然后利用水下整平設備（如水下推土機等）將河床表面整平。對于巖石河床，可能需要進行爆破或機械破碎等預處理，使基礎表面符合箱涵安裝要求。
（2）基礎加固（如有需要）：在一些地質條件較差的地方，需要對箱涵基礎進行加固。可以采用水下灌注混凝土樁或鋪設砂石墊層等方式。例如，采用鉆孔灌注樁時，要通過水下導管灌注混凝土，確保樁身質量。
箱涵吊運與定位：
（1）吊運：使用起重船將預制好的箱涵吊運至安裝位置上方。在吊運過程中，要確保箱涵的平衡和穩定，防止其傾斜或掉落。可以通過合理設置吊點位置和使用平衡裝置來實現。
（2）粗定位：利用水上和水下的測量設備對箱涵進行初步定位。根據預先設置的控制點，通過全站儀等設備在水面上指揮起重船移動，使箱涵大致位于設計安裝位置。
（3）精確定位：潛水員下水，利用水下定位設備（如聲吶定位儀）對箱涵進行精確調整。調整箱涵的平面位置和高程，使其滿足設計精度要求，誤差一般控制在幾厘米范圍內。
箱涵連接與固定：
（1）連接方式：箱涵之間的連接可以采用止水橡膠帶和鋼性連接相結合的方式。在相鄰箱涵的接口處安裝止水橡膠帶，通過螺栓或焊接等方式將箱涵的連接部分固定，確保接口的密封性和整體性。
（2）水下混凝土澆筑（如果需要）：對于一些重要的連接部位或需要加強的部位，可以進行水下混凝土澆筑。例如，在箱涵的底部和兩側澆筑混凝土，使箱涵與基礎更好地結合，同時增強箱涵之間的連接強度。水下混凝土澆筑要通過導管進行，防止混凝土離析，并且要保證混凝土的質量符合設計要求。
檢查與驗收：
（1）外觀檢查：潛水員下水對安裝好的箱涵進行外觀檢查，查看箱涵是否有損壞、接口是否密封良好、連接部位是否牢固等情況。
（2）功能性測試：根據箱涵的用途進行相應的測試。如果是排水箱涵，進行通水試驗，檢查水流是否順暢、有無滲漏現象；如果是用于交通的箱涵，要檢查其承載能力是否符合設計要求。